Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap25P60879 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap25P60879 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms