Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3bP59470 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms