Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps5P59438 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps5P59438 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms