Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nphp4P59240 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nphp4P59240 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nphp4P59240 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nphp4P59240 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nphp4P59240 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nphp4P59240 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms