Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scarf2P59222 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms