Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dpf3P58269 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms