Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm9sf2P58021 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms