Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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