Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms