Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp5P56399 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp5P56399 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp5P56399 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms