Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CtskP55097 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtskP55097 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtskP55097 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtskP55097 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtskP55097 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtskP55097 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtskP55097 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtskP55097 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtskP55097 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtskP55097 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtskP55097 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtskP55097 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtskP55097 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtskP55097 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtskP55097 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtskP55097 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtskP55097 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtskP55097 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtskP55097 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtskP55097 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtskP55097 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CtskP55097 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms