Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GemP55041 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GemP55041 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GemP55041 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GemP55041 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GemP55041 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms