Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Faf1P54731 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Faf1P54731 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms