Protein–RNA interactions for Protein: P53784

Sox3, Transcription factor SOX-3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox3P53784 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox3P53784 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox3P53784 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox3P53784 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox3P53784 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox3P53784 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox3P53784 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms