Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux1P53564 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux1P53564 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux1P53564 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux1P53564 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux1P53564 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux1P53564 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux1P53564 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux1P53564 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux1P53564 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux1P53564 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms