Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Map3k1P53349 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms