Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp10P52479 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp10P52479 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp10P52479 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp10P52479 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp10P52479 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms