Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApodP51910 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApodP51910 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApodP51910 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApodP51910 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms