Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms