Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FmodP50608 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FmodP50608 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FmodP50608 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FmodP50608 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FmodP50608 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FmodP50608 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FmodP50608 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FmodP50608 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FmodP50608 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FmodP50608 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms