Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LtbrP50284 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LtbrP50284 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LtbrP50284 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LtbrP50284 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LtbrP50284 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LtbrP50284 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LtbrP50284 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LtbrP50284 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LtbrP50284 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LtbrP50284 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LtbrP50284 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LtbrP50284 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms