Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BckdhaP50136 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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