Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psen1P49769 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms