Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpreP49446 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpreP49446 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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