Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp3P49194 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms