Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms