Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox1P48437 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prox1P48437 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms