Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms