Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41P48193 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Epb41P48193 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
Epb41P48193 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb41P48193 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms