Protein–RNA interactions for Protein: P47964

Rpl36, 60S ribosomal protein L36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl36P47964 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl36P47964 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl36P47964 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl36P47964 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl36P47964 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl36P47964 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl36P47964 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl36P47964 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl36P47964 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl36P47964 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl36P47964 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl36P47964 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl36P47964 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl36P47964 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl36P47964 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl36P47964 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl36P47964 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl36P47964 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl36P47964 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl36P47964 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms