Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms