Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TfamP40630 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TfamP40630 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TfamP40630 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TfamP40630 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TfamP40630 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TfamP40630 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TfamP40630 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TfamP40630 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TfamP40630 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TfamP40630 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TfamP40630 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TfamP40630 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TfamP40630 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TfamP40630 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TfamP40630 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TfamP40630 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms