Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd9P40240 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd9P40240 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd9P40240 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd9P40240 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd9P40240 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd9P40240 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms