Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tjp1P39447 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms