Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sar1aP36536 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sar1aP36536 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms