Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6fP35460 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms