Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms