Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stfa3P35173 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms