Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptk2P34152 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms