Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rom1P32958 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rom1P32958 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rom1P32958 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rom1P32958 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rom1P32958 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rom1P32958 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rom1P32958 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rom1P32958 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rom1P32958 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rom1P32958 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rom1P32958 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rom1P32958 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rom1P32958 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rom1P32958 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rom1P32958 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rom1P32958 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rom1P32958 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rom1P32958 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rom1P32958 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rom1P32958 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rom1P32958 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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