Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc5P32043 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc5P32043 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc5P32043 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms