Protein–RNA interactions for Protein: P31650

Slc6a11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a11P31650 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a11P31650 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms