Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc11P31313 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms