Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnd1P30999 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms