Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tacr1P30548 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms