Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd3P30282 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms