Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pabpc1P29341 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms