Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RxraP28700 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RxraP28700 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RxraP28700 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RxraP28700 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RxraP28700 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RxraP28700 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RxraP28700 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RxraP28700 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RxraP28700 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RxraP28700 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RxraP28700 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RxraP28700 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RxraP28700 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RxraP28700 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxraP28700 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxraP28700 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxraP28700 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxraP28700 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxraP28700 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxraP28700 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxraP28700 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxraP28700 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxraP28700 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxraP28700 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RxraP28700 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RxraP28700 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms