Protein–RNA interactions for Protein: P28650

Adssl1, Adenylosuccinate synthetase isozyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adssl1P28650 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Adssl1P28650 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Adssl1P28650 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms