Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apex1P28352 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apex1P28352 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms